噴霧干燥后的物料粒度是可控的。工程師和操作人員通過精確調控霧化器參數、優化料液配方等，也可以像“編程"一樣，在一個較寬的范圍內設計和生產出具有特定粒度分布的粉末產品，以滿足客戶應用對溶解速度、流動性、堆密度等特性的要求。
霧化器是將液體破碎成微小液滴的裝置，而一個液滴最終通常會形成一個粉末顆粒。因此，控制液滴大小是控制粉末粒度的最直接方法。選擇不同類型的霧化器及其操作參數，是控制粉末粒度范圍的方法。
1、離心式霧化器（轉盤），調節轉盤轉速，這是最主要的控制方式。轉速越高，產生的液滴越細小，粉末也越細。轉速與粉末粒徑近似成反比關系，轉盤的溝槽設計和直徑也會影響粒度。
2、氣流式噴嘴（二流體），調節霧化氣流的壓力和流量（氣液比），氣液比越大，霧化能量越強，液滴被撕裂得越細小，粉末粒度也越細。氣流式噴嘴通常能產生最細的液滴。
料液的物理性質決定了它被霧化的難易程度。
1、固含量：降低固含量，意味著每個液滴里含有的固體物質更少，干燥后形成的顆粒自然更小、更輕。但會降低產量，增加能耗。
2、粘度：降低粘度，使料液流動性更好，更容易被霧化器破碎成細小的液滴。可通過加熱或添加溶劑來降低粘度。
3、進風溫度：適當提高進風溫度，可以加速液滴表面水分的蒸發，使其快速形成一層干燥的“硬殼"，從而固定顆粒形態，防止相互粘連，有助于保持原始的細小粒度。
盡管可控性很高，但噴霧干燥也有其局限性：
粒度范圍：通常，噴霧干燥能經濟地生產的粉末粒度范圍在50 微米到100微米之間。
并非均勻：噴霧干燥得到的是一個粒度分布，即粉末由不同大小的顆粒組成。我們的目標是控制這個分布的中位粒徑（D50）和分布的寬窄，而無法得到單一粒度的粉末。
顆粒結構：噴霧干燥顆粒通常是球形和中空的。這種獨特的結構（如溶解性、密度、流動性）與通過研磨得到的實心不規則粉末不同。